Согласно Водному кодексу Российской Федераций (далее — ВК РФ) использование водных объектов представляет собой получение различными способами пользы от водных объектов для удовлетворения материальных и иных потребностей граждан и юридических лиц, а пользование водными объектами (водопользование) — юридически обусловленная деятельность граждан и юридических лиц, связанная с использованием водных объектов. При этом пользование водными объектами является платным.
На момент вступления в силу в 1995 г. ВК РФ плата за пользование водными объектами взималась в виде платы за воду, вбираемую промышленными предприятиями из водохозяйственных систем. Данная плата взималась в порядке, установленном Письмом Министерства финансов Российской Федераций от 27.05.1991 г. № 16/111 «Об исчислении и внесении в бюджет плати за воду». В соответствии с Законом РФ от 27.12.1991 г. № 2118-1 «Об основах налоговой системы в Российской Федерации» она относилась к региональным налогам, устанавливалась законодательными актами Российской Федерации и взималась на всей ее территории. Конкретные ставки платы определялись законами республик в составе Российской Федерации или решениями органов государственной власти краев, областей, автономной области, автономных округов, если иное не было установлено законодательными актами Российской Федерации.
Плательщиками платы за воду признавались промышленные предприятия (объединения), включая предприятия теплоэнергетики, независимо от форм собственности, состоящие на хозяйственном расчете, имеющие самостоятельный баланс и являющиеся юридическими лицами.
Плательщики вносили в бюджет плату за воду, забираемую для собственных нужд, независимо оттого, поступает эта вода непосредственно из водохозяйственных систем (поверхностных или подземных источников), от других промышленных предприятий или от предприятий коммунального хозяйства.
При получении воды от поставщиков (других промышленных предприятий, предприятий коммунального хозяйства и т. п.) промышленные предприятия не только перечисляли плату в бюджет за воду, но и оплачивали поставщикам услуги по подаче воды.
Действующая система платежей за пользование водными объектами сформировалась в 1998 г. после введения в действие Федерального закона от 6.05.1998 г. № 71-ФЗ «О плате за пользование водными объектами», подготовленного в целях совершенствования налоговой системы РФ. Данным Законом плата за воду, забираемую из водохозяйственных систем, была заменена платой за пользование водными объектами.
Плательщиками платы за пользование водными объектами были признаны не только промышленные предприятия, но и все организации и индивидуальные предприниматели, непосредственно осуществляющие пользование водными объектами (кроме подземных водных объектов, воды которых содержат полезные ископаемые и (или) природные лечебные ресурсы (минеральные воды) либо используются для получения тепловой энергии) с применением сооружений, технических средств или устройств, подлежащих лицензированию в порядке, установленном законодательством Российской Федерации.
На момент принятия Федерального закона «О плате за пользование водными объектами» плата за их пользование зачислялась в федеральный бюджет и бюджеты субъектов Российской Федерации в размере 40 и 60% соответственно. При этом устанавливалось, что не менее 50% средств направляется на восстановление и охрану водных объектов. С 2002 г. данный налог в размере 100% зачислялся в доход бюджетов субъектов Федерации. Кроме того, Законом было закреплено право законодательных органов субъектов Российской Федерации устанавливать льготы по плате за пользование водными объектами для отдельных категорий плательщиков в пределах сумм, поступающих в бюджет соответствующего субъекта РФ.
Однако, учитывая, что плата за пользование водными объектами на основании Закона РФ «Об основах налоговой системы в Российской Федерации» отнесена к налоговым платежам, а налог в соответствии с частью первой НК РФ может быть установлен только законодательством о налогах и сборах, был принят Федеральный закон от 28.07. 2004 г. № 83-ФЗ «О внесении изменений в часть вторую НК РФ, изменений в статью 19 Закона Российской Федерации “Об основах налоговой системы в Российской Федерации”, а также о признании утратившими силу отдельных законодательных актов Российской Федерации». Указанным Законом разд. VIII части второй НК РФ дополнен главой 25.2 «Водный налог». В соответствии со ст. 13 НК РФ водный налог отнесен к федеральным налогам. Это значит, что субъекты Российской Федерации уже не вправе изменить то, что установлено главой 25.2.
Как показала практика исчисления и взимания платы за пользование водными объектами, каких-либо серьезных неразрешимых проблем по данному вопросу не возникло. Поэтому глава «Водный налог» естественным образом повторяет структуру и содержание Федерального закона от 6.05.1998 г. № 71-ФЗ «О плате за пользование водными объектами». В главе предусмотрены необходимые для установления основные элементы налога, определены специфические ставки налога по бассейнам рек, озер, морей и экономическим районам, исключены отдельные налоговые льготы, установленные действующим законодательством о плате за пользование водными объектами. Из объекта налогообложения исключен такой вид пользования водными объектами, как сброс сточных вод в водные объекты. В целях сохранения поступлений в бюджет от данного налога одновременно увеличены ставки водного налога за забор воды из водных объектов на сумму, соответствующую поступлениям от платы за сброс сточных вод.
В связи с принятием главы «Водный налог» Федеральный закон «О плате за пользование водными объектами» признается недействующим.