На смену ятрохимии пришла теория флогистона, объяснявшая процесс горения тем, что вещества содержат некую составную часть, именуемую флогистоном, которую они якобы теряют при горении. Самым знаменитым среди многочисленных последователей этой теории является шведский аптекарь Карл Шееле (1742 – 1786), открывший глицерин, хлор, марганец, а также ряд органических кислот (лимонную, яблочную, щавелевую, винную). Теорию флогистона опроверг М. В.Ломоносов (1711 – 1765). Его теория кислорода завоевала всеобщее признание и явилась стимулом для дальнейших научных исследований. В этот период значительное развитие получило естествознание, происходят значительные открытия в медицине, химии, фармации, созданы новые научные направления: аналитическая химия, фитохимия, органический синтез лекарственных средств, микробиология, химиотерапия. Аптека превратилась в лабораторию, где на основе строго проверенных опытов и наблюдений было сделано много открытий.
Видное место в разработке методов аналитической химии занимает фармацевт К. Ф. Мор (1806 – 1879) – автор объемного анализа. Его имя до сих пор носят бюретки, пипетки, весы, зажимы, краны.
Фармацевты XIX в. сыграли огромную роль в создании экспериментальной гигиены, основоположник которой М. Петенкофер (1818 – 1901) прошел путь от аптекарского ученика до аптекаря, управляющего придворной аптекой. После него все фармацевты считали своим долгом проводить исследования в области экспериментальной гигиены.
Судебная химия целиком создана фармацевтами, среди которых следует назвать Г. Драгендорфа (1836 – 1898) и Ю. К.Траппа (1814 – 1908). Последний известен как автор семи фармакопеи. Судебно-химические исследования, согласно законам того времени, были исключительной прерогативой и обязанностью фармацевтов.
В 1912 г. открытием сальварсана П. Эрлих (1854 – 1915) положил начало химиотерапии. В 1935 г. Г. Домагк (1895 – 1964) открыл первый сульфаниламидный препарат – пронтозил, известный в нашей стране как красный стрептоцид. С открытием этого препарата началась новая эра в терапии. А. Флеминг (1881 – 1955) в 1929 г. обнаружил антибактериальные свойства вещества, выделенного из плесени. Оно было названо пенициллином и стало первым антибиотиком, положившим начало новому периоду в развитии медицины и фармации. Только через 12 лет Э. Б.Чейн и X. У. Флори смогли выделить пенициллин в чистом виде и использовать для лечения больных.
В 50-е гг. XX в. созданы первые психотропные препараты, пероральные диуретики и противодиабетические препараты.
Десятилетие спустя появились первые транквилизаторы, b-адреноблокаторы, иммунодепрессанты, противовирусные препараты.
Созданием антагонистов ионов кальция, блокаторов ангиотензинконвертирующего фермента, генноинженерных интерферонов, интерлейкинов, производных простагландинов ознаменовались 70-е гг.
В 80-е гг. открываются и изучаются эндотелиальные факторы, лейкотриены, натрийуретический фактор, активаторы и блокаторы калиевых каналов, ведется поиск веществ, влияющих на когнитивные функции.
В конце XX – начале XXI в. достигнуты поразительные успехи в расшифровке генома человека и генома бактерий.
Эти огромные достижения открывают дорогу к получению новых лекарств направленного действия, о которых мечтают врачи и ученые всего мира.